人類的日常生存環(huán)境中存在著無窮無盡的病原體,而抗體是人體免疫系統(tǒng)對抗外界病原體入侵的主要分子“士兵”。這些人類的抗體分子由B淋巴細(xì)胞分泌的免疫球蛋白構(gòu)成。當(dāng)病原體入侵我們的免疫系統(tǒng)時,淋巴細(xì)胞通過基因突變等方法,利用甚至不足一百納米的DNA編碼多種多樣的抗體分子,“以萬變應(yīng)萬變”,產(chǎn)生能夠針對性結(jié)合入侵病原體的抗體分子,這個過程被稱為抗體親和力成熟。
抗體分子在分子水平上長得像一個兩臂舉著武器的字母“Y”,最頂端的氨基酸是識別病原體的“武器”,而下方“身體”部分的氨基酸則負(fù)責(zé)維持抗體結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定和信息傳遞。不同的抗體分子擁有大致相同的“身體”,但它們頂部的“武器”卻千差萬別。
1981年,美國免疫學(xué)家大衛(wèi)?巴爾的摩等人發(fā)現(xiàn),在抗體親和力成熟過程中,基因突變更傾向于發(fā)生在編碼識別病原體的“武器”區(qū)域。在一百納米的范圍內(nèi),基因突變?yōu)楹尉哂衅眯?,一直是分子免疫學(xué)家苦苦追尋的問題。
4月24日深夜,國際學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》在線發(fā)表了中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)孟飛龍研究組和上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院上海市免疫學(xué)研究所葉菱秀研究組的合作研究論文。這一工作發(fā)現(xiàn)抗體基因DNA的力學(xué)性能,特別是柔性,決定了抗體親和力成熟過程中的基因突變效率。
在人體免疫系統(tǒng)中,B淋巴細(xì)胞是制造抗體士兵的工廠。它可以解讀抗體基因遺傳信息,并將其加工為一個個合格的士兵?!鞍彰摪泵窤ID”是B細(xì)胞工廠流水線上的魔鬼教練,他可以在抗體基因上制造基因突變,從而打造不同的抗體士兵。在抗體士兵的“武器”區(qū)域產(chǎn)生突變,可以產(chǎn)生擁有不同武器的士兵。但是如果在抗體士兵的“身體”部位產(chǎn)生突變,則可能產(chǎn)生不合格的士兵。
為什么在抗體基因上“武器”區(qū)域更容易發(fā)生突變,而“身體”區(qū)域的突變相對較少。上??茖W(xué)家的工作發(fā)現(xiàn),原來抗體基因上“武器”區(qū)域更加柔軟,“身體”區(qū)域相對僵硬。在柔軟的地方,魔鬼教練更容易訓(xùn)練該處的基因,從而產(chǎn)生更多的突變。
這是魔鬼教練(工具酶)和士兵材料(底物DNA)在漫長的進(jìn)化過程中雙向奔赴的結(jié)果。相關(guān)機(jī)制在人類、猴子、小鼠、羊駝、兔子、狗甚至是鴨嘴獸中都普遍存在。
在人體細(xì)胞內(nèi)部總長2米的DNA鏈條上,有的地方彎曲,有的地方筆直。該工作發(fā)現(xiàn)在抗體士兵制造過程中,DNA的柔性發(fā)揮了重要作用,也提示DNA柔性等力學(xué)性質(zhì)可能在其它生命活動如腫瘤發(fā)生發(fā)展中,發(fā)揮重要作用。
分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心博士生王燕燕為該論文的第一作者,中心孟飛龍研究員和上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院葉菱秀研究員為該論文的共同通訊作者。上海師范大學(xué)數(shù)學(xué)系博士生張森欣在數(shù)據(jù)分析,上海交通大學(xué)博士生楊欣瑞在分子動力學(xué)模擬,哈佛大學(xué)Joyce Hwang和王寵在模型構(gòu)建等方面作出重要貢獻(xiàn)。該工作得到上海交通大學(xué)達(dá)林泰教授、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院鄭小琪教授、哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院Frederick W. Alt教授、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)趙要風(fēng)教授、瑞典卡羅林斯卡研究所Qiang Pan-Hammarstr?m教授、中國科學(xué)院杭州醫(yī)學(xué)所宋杰研究員、中國科學(xué)院生物物理研究所黃韶輝研究員、復(fù)旦大學(xué)曹志偉教授、分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心劉珈泉研究員等合作實(shí)驗(yàn)室老師和同學(xué)的大力支持。該工作得到分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心動物實(shí)驗(yàn)技術(shù)平臺、細(xì)胞分析技術(shù)平臺、分子生物學(xué)技術(shù)平臺的支持,同時得到來自基金委、科技部、中國科學(xué)院、上海市科委等部門的經(jīng)費(fèi)支持。
原載于東方網(wǎng) 2023年4月25日
作者:傅文婧