北京時(shí)間3月28日,國際學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》(Cell)在線發(fā)表了中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)汪勝研究組聯(lián)合上??萍即髮W(xué)iHuman研究所程建軍團(tuán)隊(duì)、中國科學(xué)院上海藥物所徐華強(qiáng)團(tuán)隊(duì)的合作研究成果:“Flexible Scaffold-based Cheminformatics Approach for Polypharmacological Drug Design”。該研究綜合運(yùn)用化學(xué)信息學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、細(xì)胞功能學(xué)、在體動(dòng)物行為學(xué)等多學(xué)科技術(shù)手段,提出了一種名為“基于可變形骨架的化學(xué)信息學(xué)方法(FSCA)”的全新多靶點(diǎn)、多功效藥物設(shè)計(jì)理念,為治療復(fù)雜精神疾病的藥物開發(fā)提供了一條新路徑。
精神疾病的治療一直以來是醫(yī)學(xué)界的一大挑戰(zhàn)。這些疾病的發(fā)病機(jī)理異常復(fù)雜,癥狀表現(xiàn)也千差萬別。以精神分裂癥與癡呆癥為例,這兩類精神病患既發(fā)精神錯(cuò)亂、也表現(xiàn)出記憶力減退、思維混亂等認(rèn)知障礙。傳統(tǒng)的單一靶點(diǎn)藥物難以滿足患者的需求,而組合用藥往往面臨藥物體內(nèi)互作帶來的未知副作用風(fēng)險(xiǎn)。因此,研發(fā)一種能夠同時(shí)作用于多個(gè)靶點(diǎn)的藥物變得至關(guān)重要。然而,如何設(shè)計(jì)這種多靶點(diǎn)、多功效藥物一直以來都是一大難題。
以血清素2A受體與1A受體為例,這兩個(gè)受體是許多精神疾病藥物的主要靶點(diǎn)。匹莫范色林(Pimavanserin)是一種選擇性拮抗血清素2A受體的藥物,在緩解精神分裂癥、阿爾茲海默癥和帕金森病相關(guān)的精神錯(cuò)亂癥狀方面表現(xiàn)出顯著的臨床療效,但并未能延緩患者的認(rèn)知減退進(jìn)程(Friedman, N Engl J Med 2021; Meltzer et al., Schizophr Res 2012)。另一方面,血清素1A受體的激動(dòng)劑(例如坦度螺酮Tandospirone)能夠改善老年癡呆癥患者的精神錯(cuò)亂癥狀(Ochi et al., Clin Psychopharmacol Neurosci 2021)。在精神分裂癥治療中,坦度螺酮與典型抗精神病藥物氟哌啶醇(Haloperidol)聯(lián)用可同時(shí)改善精神錯(cuò)亂以及部分認(rèn)知功能(Sumiyoshiet al., Am J Psychiatry 2001)。研究團(tuán)隊(duì)于是嘗試設(shè)計(jì)同時(shí)作用于這兩類受體的多靶點(diǎn)、雙向活性的化合物分子,即拮抗血清素2A受體和激活血清素1A受體,以實(shí)現(xiàn)雙向調(diào)控精神疾病癥狀的目標(biāo)。
“北冥有魚,其名為鯤……化而為鳥,其名為鵬?!鼻f周在《逍遙游》中描繪了一幅大象無形的綺麗畫卷。在不同的情境下,具象可以相互轉(zhuǎn)化。與之類似,多靶點(diǎn)藥物分子如同鯤鵬,在結(jié)合不同類型受體時(shí)也可以發(fā)生形態(tài)轉(zhuǎn)化,通過調(diào)整分子本身構(gòu)象狀態(tài)和結(jié)合姿勢,以適應(yīng)不同受體口袋的形狀,對(duì)受體活性進(jìn)行調(diào)節(jié)。
汪勝研究組基于多年來對(duì)受體結(jié)構(gòu)藥理研究發(fā)現(xiàn):血清素受體家族的激動(dòng)劑配體傾向于采取“舒展向上”的結(jié)合狀態(tài),而拮抗劑配體則傾向于采取“彎折向下”的結(jié)合狀態(tài)。具有代表性的激動(dòng)劑和拮抗劑分別是致幻劑LSD和抗精神病藥物盧美哌隆。LSD的麥角林四環(huán)骨架在受體中呈現(xiàn)近似平面構(gòu)象,而側(cè)鏈二乙基酰胺基團(tuán)則伸展向上,結(jié)合于受體淺表口袋;與之相反,盧美哌隆的四環(huán)骨架在受體中呈現(xiàn)彎折構(gòu)象,與之相連的丁酮基氟苯基團(tuán)則斜插向下,結(jié)合于受體的深部口袋。研究人員因此提出:具備類似構(gòu)造的藥物,其結(jié)合受體的模式可預(yù)測其藥效活性。在這一理念的啟發(fā)下,研究人員首先運(yùn)用化學(xué)信息學(xué)手段從ChEMBL與Enamine兩大化合物庫中篩選出具備可變構(gòu)象特征的多環(huán)骨架,連接第二藥效團(tuán)氟苯環(huán)后,使得完整分子在結(jié)合血清素1A受體與2A受體時(shí)可分別采取“舒展向上”和“彎折向下”兩種構(gòu)象狀態(tài),從而實(shí)現(xiàn)激動(dòng)血清素1A受體與拮抗血清素2A受體的雙向活性。為驗(yàn)證這一理念,研究人員選取具有代表性的四環(huán)骨架與氟苯基團(tuán)相連,合成了IHCH-7179,并通過細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)、復(fù)合物結(jié)構(gòu)解析、行為藥理學(xué)等多維角度驗(yàn)證了該分子的多重藥理特性。
該研究融合了化學(xué)信息學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)以及行為藥理學(xué)等多學(xué)科技術(shù)手段。通過這些方法,研究團(tuán)隊(duì)成功鑒定出通用可變形骨架所應(yīng)具備的特征,并提出了一種全新的多靶點(diǎn)、多功效活性的藥物設(shè)計(jì)思路。這一研究成果深化了我們對(duì)于復(fù)雜精神疾病藥物治療的藥理認(rèn)知,為未來開發(fā)更多、更有效針對(duì)復(fù)雜疾病的多靶點(diǎn)藥物提供了重要的理論指導(dǎo)。
分子細(xì)胞卓越中心陳章成博士、余競助理研究員,上??萍即髮W(xué)iHuman研究所王歡副研究員,中國科學(xué)院上海藥物所徐沛雨博士(現(xiàn)為MIT和Broad研究所博士后)為該論文共同第一作者。分子細(xì)胞卓越中心汪勝研究員、上??萍即髮W(xué)iHuman研究所程建軍研究員、上海藥物所徐華強(qiáng)研究員為論文通訊作者。此外,北京康邁迪森公司提供重要的計(jì)算資源支持,分子細(xì)胞卓越中心裴鋼院士團(tuán)隊(duì)在APP/PS1早老性癡呆小鼠模型方面提供協(xié)助。該項(xiàng)研究工作得到國家自然科學(xué)基金、科技部重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目、上海市自然科學(xué)基金、中國科學(xué)院青年促進(jìn)會(huì)等資助。
文章鏈接:https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(24)00237-X

圖: (A) 以IHCH-7179為代表的多靶點(diǎn)、多功效活性的藥物前體分子的設(shè)計(jì)理念及其在精神分裂癥與癡呆癥治療中的潛在應(yīng)用;(B)運(yùn)用化學(xué)信息學(xué)方法從ChEMBL與Enamine兩大化合物庫中篩選具備可變構(gòu)象特征的多環(huán)系骨架。