周小龍、王恩多研究組合作揭示人線粒體tRNA t6A修飾的分子機制
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時間:2020-02-12
2月12日,國際學術期刊Nucleic Acids Research在線發(fā)表了中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心 (生物化學與細胞生物學研究所)周小龍、王恩多研究組的最新研究成果“Molecular basis for t6A modification in human mitochondria”。該研究揭示了人線粒體tRNA反密碼子環(huán)第37位腺嘌呤N6-蘇氨?;紫佘账?N6-Threonylcarbamoyladenosine, t6A)修飾的分子機制。
t6A修飾是廣泛存在于三界生物中,負責解碼ANN (N = A, T, G, C)密碼子的tRNA 第37位腺嘌呤上的一種化學修飾,調控mRNA翻譯的速度與精確性。負責t6A修飾的基因在三界生物中已被鑒定,但對其分子機制及生物學功能的認識有限,且絕大多數(shù)來自于研究原核生物t6A修飾機器,對于高等哺乳動物tRNA t6A修飾缺乏認識。人YrdC/OSGEPL1催化線粒體tRNA的t6A修飾,而YrdC/KEOPS負責細胞質tRNA的t6A修飾。核基因組6個基因負責人tRNA的t6A修飾,每一個基因發(fā)生的突變會使t6A修飾缺陷,均導致Galloway-Mowat 綜合癥。三界生物中,催化t6A修飾的酶如何識別和選擇特定的tRNA、催化過程中關鍵的氨基酸殘基、t6A修飾潛在的調節(jié)機制等均不清楚。
本項研究中,研究人員揭示了人線粒體tRNA的t6A修飾酶OSGEPL1的特點、OSGEPL1識別tRNA的分子機制以及OSGEPL1乙?;{控t6A修飾活力的機制。原核生物、釀酒酵母細胞質及線粒體中,負責tRNA的t6A修飾的TsaD/Kae1/Qri7蛋白質家族均以多元復合物或二聚體形式存在,而人線粒體OSGEPL1是目前發(fā)現(xiàn)的唯一以單體發(fā)揮催化功能的修飾酶。在人線粒體22種tRNA中,已經(jīng)鑒定到5種tRNA [hmtRNAAsn, hmtRNAIle, hmtRNALys, hmtRNASer(AGY)以及hmtRNAThr]上帶有t6A修飾,他們發(fā)現(xiàn)在體外hmtRNAThr (蘇氨酸t(yī)RNA)是t6A修飾的最好底物;通過hmtRNAThr反密碼子環(huán)構建一系列突變,發(fā)現(xiàn)OSGEPL1是唯一利用tRNA分子上的C34作為負識別元件的t6A修飾酶,其識別tRNA的核酸基序為(C/A>U>G)32-N33-(U/G>A)34-N35-U36A37A38 (N為任意堿基);有趣的是在細菌、酵母細胞質及線粒體中tRNA的C34并不是負識別原件。他們還發(fā)現(xiàn),OSGEPL1 上帶有Lys203和Lys299兩個乙?;稽c,Lys203是結合tRNA的關鍵殘基,其乙?;瘜е旅附Y合tRNA的能力變弱,從而降低OSGEPL1的t6A修飾活力及水平;而Lys299乙?;瘎t通過調節(jié)酶的局部構象,使該酶的t6A修飾活力及水平顯著上升。
本研究首次揭示了人線粒體tRNA的t6A 修飾酶OSGEPL1的特性、識別tRNA的分子機制及其乙?;{控tRNA的t6A修飾的機制,為認識其它非線粒體tRNA的t6A修飾的分子基礎、揭示修飾酶及tRNA突變相關人類疾病的發(fā)生機制提供了理論基礎。
博士研究生周敬波為本文第一作者,周小龍研究員與王恩多研究員為本文共同通訊作者。本研究得到了中國科學院分子細胞科學卓越創(chuàng)新中心(生物化學與細胞生物學研究所)周金秋研究員、復旦大學閆孟紅博士以及國家蛋白質中心(上海)的大力支持。本研究得到國家重點研發(fā)計劃、基金委以及中科院的經(jīng)費資助。
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人線粒體tRNA修飾酶及其修飾的分子機制